智元研究院和电科36所都是国内知名的科研机构，专注于科学研究和技术创新。以下是它们各自的优势和特点：
智元研究院是由清华大学前校长、国家电子信息产业发展研究院院长朱清时教授创立的研究机构，主要从事信息科技前沿领域的研究和创新。智元研究院在人工智能、物联网、大数据、区块链等领域有着深入的研究和实践经验，曾获得多项国内外的科技奖项和专利，同时也与国内外的多家知名企业和机构合作开展项目。智元研究院的研究成果在学术界和行业内都有较高的影响力和知名度。
电科36所是中国电子科技集团公司旗下的一家研究机构，成立于1957年，历史悠久。电科36所主要从事电子信息、通信、雷达、导航、控制、计算机、信息安全等领域的研究和开发，拥有多项国家级和省部级科技成果和专利。电科36所在航空航天、国防军工等领域具有较强的技术实力和研发能力，曾参与多项国家重大科技项目和战略性新兴产业的研究和开发。
需要根据自己的具体需求和研究方向选择合适的机构进行合作。如果您需要从事信息科技前沿领域的研究和创新，可以考虑与智元研究院合作；如果您的研究方向在电子信息、航空航天、国防军工等领域，可以考虑与电科36所合作。